Jump to Navigation

Blogs

Συμβόλαιο Μαθήματος

Μπορείτε να κατεβάσετε στον υπολογιστή σας το συμβόλαιο μαθήματος (PDF).

1η Κατ' οίκον εργασία - Καταληκτική Προθεσμία: Κυριακή 12/02/2012

Από την τελευταία έκδοση για Βάσεις Δεδομένων Μοριακής Βιολογίας (Database Issue) του περιοδικού Nucleic Acids Research, να επιλέξετε ένα άρθρο που σας ενδιαφέρει και να συντάξετε μια μικρή παράγραφο στην οποία θα απαντάτε σύντομα στις παρακάτω ερωτήσεις:
 
1. Τι είδους δεδομένα περιέχονται στη συγκεκριμένη βάση δεδομένων;
2. Ποιά πιστεύετε ότι είναι η χρησιμότητα αυτής της βάσης δεδομένων;
 
Τις απαντήσεις σας να τις στείλετε με ηλεκτρονικό ταχυδρομείο (vprobon@ucy.ac.cy) μέχρι την Κυριακή 12/02/2012.
 

Εισαγωγικό Υλικό

Μπορείτε να βρείτε εισαγωγικό υλικό για μελέτη: 
Εισαγωγικό υλικό στη Μοριακή Βιολογία από το Μάθημα ΒΙΟ 101 του Αν. Καθ. Λεόντιου Κωστρίκη: Σημειώσεις (αρχείο PDF)
 
"Στοιχεία Μοριακής Βιολογίας – Βιολογικά Μακρομόρια" και "Επισκόπηση του πεδίου της Υπολογιστικής Βιολογίας - Βιοπληροφορικής": Διαφάνειες (αρχείο PDF)

BIO003

Καλώς ήρθατε στην ιστοσελίδα του μαθήματος ΒΙΟ003!
Εδώ θα βρείτε υλικό σχετικό με το μάθημα.
Χαιρετισμούς,
ΒΙΟ003 admin
 

Project Files (on the "student" server).

You may copy the following files into your student account:
Assignment 1:

Details on seminar projects

Follow the link to find more details on your project: Project details

Seminar information

Group assignments and some initial guidelines [Download].

Pairwise sequence comparison - a short exersise

Here are a few sequences in FASTA format:
Sequence 1: Collagen alpha-1(II) chain, Homo sapiens 
Sequence 2: Collagen alpha-1(II) chain, Bos taurus
Sequence 3: Glycine-rich RNA-binding protein 8, Arabidopsis thaliana
 
Let's do the tricks now!
Dot plot using Dotlet (Swiss Institute of Bioinformatics).

Notes on Sequence Analysis - Σημειώσεις στην Ανάλυση Αλληλουχιών

1st package of notes [in Greek].
Covers an introduction in biological macromolecular sequences and computational methods for sequence similarity analysis. [Download]. 
2nd package of notes [in Greek].

Linux/Unix Basics

New material posted (PDF lecture slides) - Διαλέξεις μαθήματος

Course syllabus - Περιεχόμενο Μαθήματος

/BRLnew/drupal-7.0/sites/default/files/AnalytikoProgramma.pdf

/BRLnew/drupal-7.0/sites/default/files/AnalytikoProgrammaDialeksewn.pdf

Σημείωση: Εκ παραδρομής οι ημερομηνίες στο αντίτυπο που πήρατε στην 1η διάλεξη αναγράφουν εκ παραδρομής 2010 αντί για 2011 ...

Library Announcement: e-books - Βιβλία Κλειστού Δανεισμού

The following book titles are reserved for this course in the UCY library, but also in electronic form (e-book):  

 

- Bioinformatics and Functional Genomics by Jonathan Pevsner, John Wiley & Sons.  

- Bioinformatics: A Practical Guide to the Analysis of Genes and Proteins (Methods of Biochemical Analysis) by Andreas D. Baxevanis, and Francis Ouellette, John Wiley& Sons  

 

You may read or borrow them from the UCY library web-page by following the links

BIO 331 - Computational & Systems Biology (formerly: Principles and Methods of Bioinformatics [Fall 2011 - 2012])

Welcome to the BIO 331 - Computational & Systems Biology (formerly: Principles and Methods of Bioinformatics) course!

 

Here you will find all related information, such as:

  • teaching material (presentations, notes)
  • data and instructions for assignments
  • links to relevant resources

Please, visit the page regularly, it is updated on a regular basis.  

Pages

Subscribe to RSS - blogs


by Dr. Radut.